单细胞DNA+Protein多组学分析加速细胞与基因治疗研发和上市

大多数细胞与基因治疗产品在生产过程中都涉及到基因修饰，在利用病毒、质粒或转座子、CRISPR等系统对细胞进行改造后，所得到的混合细胞产物具有异质性。

在病毒转染和片段插入过程中，转染/转化效率、单个细胞中的载体拷贝数、基因片段是否整合进入基因组等因素是重要的评估维度。而在使用CRISPR等编辑系统对基因组进行编辑过程中，在靶和脱靶事件、编辑的合子性、单细胞内是否发生共编辑，以及是否产生染色体的易位，这些都是在细胞和基因治疗产品开发和生产中需要进行检测和质控的环节，以保证疗法的安全性和有效性。

多组学药物质量与安全性研究解决方案

序祯达生物利用完善的多组学平台，搭建起了覆盖细胞与基因药物开发全流程的分析解决方案，在CAR-T、CAR-NK、HSC、iPSC等领域均有丰富经验。服务内容涉及细胞与基因药物药理药效研究、安全性评价、质量研究与控制、临床试验样本检测等方面。在安全性与质量评估方面，不同技术路线的产品侧重点区别如下：

①　在利用慢病毒载体的CAR-T细胞中，通常会对整合载体的拷贝数，以及载体在基因上的插入位点进行分析，研究载体插入的偏好性，与插入带来的突变风险；

②　在iPSC来源的细胞产品中，会重点考察细胞基因组的稳定性，致瘤风险相关基因突变，以及分化后细胞的特征与均一性等；

③　使用CRISPR等基因编辑技术，则需要评估编辑的在靶与脱靶效率。

单细胞DNA+Protein多组学分析优势

上述药物质量与安全性研究解决方案用到的是基于细胞群体层面的分析方法，在面对具有高度异质性的细胞产品时有一定的局限性。为了应对这种情况，序祯达引入了Mission Bio的Tapestri单细胞DNA+Protein平台，此平台可以从单细胞层面精准解析细胞与基因治疗产品基因组与表型特征，提供更精准、快捷的表征手段：

（1）批量分析提供的是平均化后的结果，无法体现出细胞之间的差异性，而单细胞DNA测序则能够直接检测出具有不同编辑结果的细胞及其数量和比例，同时明确不同细胞群中具体的编辑结果，实现定性和定量的双重目的。

（2）在单个细胞层面，单细胞DNA测序可以检测出编辑结果的合子性，即是纯合还是杂合。当有多个位点同时编辑时，可通过单细胞测序直接测定细胞内共编辑事件。此外，单次检测可得到几千甚至上万个细胞的结果，对于存在低至0.1%发生率的预期外编辑事件的细胞，如染色体易位等，也能够实现高灵敏的分辨。

（3）实现DNA+Protein多组学检测，同时检测被编辑细胞的基因型和对应的蛋白表型，这为前期患者肿瘤细胞的表征以及细胞和基因治疗回输入患者体内后的监测提供了强有力的工具。

单细胞平台一个工作流程实现多结果表征

Tapestri单细胞DNA测序，可检测SNV、Indel、CNV和易位等多种变异类型，并能根据检测的开发需求进行Panel定制，实现高灵敏度、高特异性地检测基因组或外源序列，并应用在多种细胞和基因治疗产物的表征中。以下为几种应用的举例：

（1）准确定量分析转染/转导效率
（2）定量检测不同细胞内的载体拷贝数
（3）确认在靶和脱靶编辑
（4）检测染色体易位事件
（5）精准分析多重编辑结果
（6）单细胞DNA+Protein多组学

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单细胞DNA+Protein多组学平台可以应用于细胞和基因治疗的整个研发、临床前、临床试验和商品化生产过程，加速细胞和基因治疗产品的生产、上市。