序祯达泛癌种全景变异分析平台—Illumina TruSight™ Oncology 500

2022年2月,我国国家癌症中心发布了最新的全国癌症统计数据。报告显示,2016年中国新发癌症病例约406.4万例,新发癌症死亡病例241.35万例,位居全球首位,癌症已经成为严重威胁中国人群健康的主要公共卫生问题之一。传统的癌症治疗方式已无法满足患者日益增长的生存生活质量优化的需求,近年来随着精准医学的发展,靶向用药方式开始在临床上进行尝试与应用,并取得了积极的结果,为癌症患者的治疗带来了新的突破和希望。

解决方案

序祯达泛癌种全景变异分析平台

肿瘤相关基因变异分析是药企在肿瘤靶向药物研发时进行临床试验患者入组、耐药机制研究、生物标志物发现等环节运用的重要方法。为满足研究人员在上述环节中多元化的研究需求,序祯达搭建起一条涵盖不同基因规模、肿瘤类型、技术路线,且能应对国内外不同监管需求的全景变异分析平台,确保合作伙伴能从中择选最符合自己临床项目需求及应用场景的产品,助力靶向药物的高效研究及快速上市。

微信图片_20221208135846

图:泛癌种全景变异分析平台介绍

序祯达泛癌种全景变异分析(comprehensive genomic profiling, CGP)平台涵盖关键指南及临床试验中的相关基因和分子特征,适用于实体瘤和血液肿瘤,可检测点突变、插入缺失变异、拷贝数变异、融合基因等分子特征。其中TruSight™ Oncology 500 (以下简称为TSO500)是序祯达泛癌种全景变异分析平台中的关键一员。

序祯达泛癌种全景变异分析平台—TSO500

序祯达在2019年率先引进TSO500产品,并且完成了符合CAP/CLIA的标准验证,包括准确性研究、精确性研究、检测限研究,可全面满足监管机构对于临床检测的性能要求。

01 性能展示

微信截图_20221205151232

图:TSO500产品性能表

02 产品特点

① 可同时检测肿瘤的RNA+DNA生物标志物

② TMB和MSI算法准确度高

③ 支持大样本量快速检测及分析需求

03 序祯达TSO500产品优势

运用充分的方法学验证为客户提供高准确性与可重复性的检测结果。

1、癌种特异与样本特异性验证让泛癌CGP检测更有底气:

序祯达针对不同类型肿瘤(如肺癌,乳腺癌,白血病等)与样本来源(如组织切片,穿刺,血液,骨髓等)进行完善的验证,检测结果具有>99%的分析特异性和>95%的分析敏感性。

微信图片_20221208135853

图:序祯达TSO500 assay 验证信息汇总

2、序祯达积极拓展样本种类的可及性:

在血液肿瘤研究中,骨髓样本往往比较难以获得。序祯达为确保同一个体血液样本与骨髓样本之间变异检出的可比性,衡量多个个体组织与血液样本检出变异的一致性。检出变异的一致性>98%,为客户研究血液肿瘤提供了一个更易得的采样方式。

微信图片_20221208135858

图:个体血液样本与组织样本变异检出一致性比较结果

3、全方位的产品分析性能评估以满足申报需求:

序祯达使用临床样本进行重复性验证(SNV/INDEL检出一致性>95%),并多维度摸排产品的最低检出限(样本起始量,突变频率,肿瘤纯度等)。此外,序祯达还模拟了多种不同浓度外源性干扰物对真实样本的污染情况,检出结果依旧拥有高度稳定性与准确性(>99%)。

微信图片_20221208135902

图:不同干扰物影响下样本变异检出准确性

4、针对性优化的实验方案提升FFPE样本的检测成功率:

序祯达为TSO500产品独家优化FFPE样本的抽提技术与实验方案,大大提高了FFPE样本提取总量,同时可以在同等数据量的情况下获得更好的覆盖深度。

微信图片_20221208135906

图:不同FFPE样本中DNA抽提量分布

微信图片_20221208135911

图:序祯达优化抽提方案与标准抽提方案DNA抽提总量比较

微信图片_20221208135916

图:外显子覆盖深度比较图

04 序祯达TSO500项目经验

序祯达实验室已完成数十个TSO500临床试验项目,涵盖多种实体瘤以及血液瘤,样本类型包括石蜡样本,血液样本,骨髓样本和血浆样本,涉及多种疾病类型:非小细胞肺癌,大B淋巴瘤,骨髓增生异常综合症,急性骨髓性白血病等。

近日,TSO500 Tissue配套产品——Illumina TruSight™ Oncology 500 HRD产品已上市,该产品利用Myriad Genetics的技术进行全面、准确的基因组不稳定性评分(GIS),通过这两套产品结合使用,借助HRD分析的附加值可进行全景变异分析。

 

基因科技门户 GeneTechCn.com 基因科技行业门户网站!

基因科技门户GeneTechCn.com精选文章《序祯达泛癌种全景变异分析平台—Illumina TruSight™ Oncology 500》文中所述为作者独立观点,不代表基因科技门户立场。如若转载请注明出处:https://www.genetechcn.com/920.html

(15)
打赏 微信扫一扫 微信扫一扫 支付宝扫一扫 支付宝扫一扫
基因科技基因科技管理团队
上一篇 2022年12月6日 上午11:26
下一篇 2022年12月7日 上午11:27

相关推荐

发表回复

登录后才能评论
扫码关注
扫码关注
分享本页
返回顶部