近年来,人体菌群方面的研究重磅不断,肠道微生物在人体营养代谢、神经调节,以及心脑血管、免疫、肿瘤等各类疾病的发生发展过程中均起到了至关重要的作用。如何将这些科学发现转化为有效的药物和治疗手段?这就需要深入挖掘菌群影响背后的机制,找到关键的菌种、代谢物、靶点以及生物标志物。
序祯达提供宏基因组、宏转录组、宿主基因组、蛋白组等多组学平台,解析菌群结构特征及其与宿主内外环境因素的相互作用,帮助阐明菌群在生物系统中发挥作用的机制从而助力宏基因组的深度研究。
宏基因组结合多组学 揭示脂肪肝致病机理
今年发表的一项关于代谢功能障碍相关脂肪肝(Metabolic dysfunction-associated fatty liver disease, MAFLD)的临床研究中,研究者采集了56名不同程度脂肪肝患者的临床指标、口腔和肠道宏基因组、血浆代谢组和炎症蛋白组的多组学数据,对比了不同维度数据在各个组别患者中的差异,并分析了肠道和口腔菌群对血浆代谢组和蛋白组的影响。
研究者建立了一个综合各项多组学数据指标的模型,利用此模型对患者脂肪肝严重程度的预测准确率达到94.1%,对22名患者的验证队列预测准确度达到82.7%。在临床试验中,患者在接受混合代谢激活剂(Combined metabolic activators,CMAs)治疗后多个关键指标得到逆转,脂肪肝情况得到改善。
图:MAFLD关键多组学指标
宏基因组结合宿主遗传学
多数研究聚焦于肠道菌群对慢性病等复杂疾病的影响,而这些疾病的发生往往也涉及到遗传因素。在进行复杂的数据分析时,如何抽丝剥茧,构建不同影响因素间的关系,成为一大挑战。本周序祯达特邀Illumina因美纳高级应用市场经理梁蕊做客直播间,为我们解读如何将宏基因组与宿主遗传学相结合,探索肠道微生物研究。想要了解更多宏基因组研究干货可点击下方链接预约报名观看。
参考文献:
1.Zeybel M, Arif M, Li X, et al. Multiomics Analysis Reveals the Impact of Microbiota on Host Metabolism in Hepatic Steatosis. Adv Sci (Weinh). 2022;9(11): e2104373. doi:10.1002/advs.202104373
基因科技门户GeneTechCn.com精选文章《跨越临床转化的关键领域突破,“从宏基因组到多组学”的应用策略》文中所述为作者独立观点,不代表基因科技门户立场。如若转载请注明出处:https://www.genetechcn.com/895.html