如何一站式获得高质量单细胞样本

感谢大家对序祯达SEQUANTA直播间的关注,11月22日序祯达发起了“如何一站式获得高质量单细胞样本”线上直播课,邀请到新格元高级产品经理方惠敏以及序祯达研发实验室负责人潘轶担任序祯达直播间主讲嘉宾。之前错过直播的小伙伴们不用担心,我们将回放视频和演讲内容做了以下整理。

单细胞样本一站式解决方案

新格元目前的单细胞产品体系包括PythoN和Matrix两款仪器,2款生信分析软件,以及系列的单细胞测序试剂盒。这些产品覆盖了样本前处理,单细胞分离,核酸捕获,建库,到数据分析的全流程,提供一站式的单细胞解决方案。

方惠敏在直播中对新格元PythoN组织解离仪器做了详细说明,配合直播实验环节在序祯达实验室内向观众展示PythoN组织解离仪器的便捷、迅速、高效。通过解离小鼠的肺样本,Python可以做到全自动化运行,原本手动处理样本需要30-60min,而通过PythoN组织解离仪器将组织解离时间可缩短至15min,大大降低人力成本,同时提高效率,提高实验结果的稳定性和可重复性。

序祯达研发实验室负责人潘轶在直播中也分享了自己的技术经验,“以序祯达的经验来看,样本的组织类型非常的多元化,需要针对性的处理方案,比如肝脏组织细胞脆弱,核酸易降解,比较难以处理。我们在以前的项目中总结了很多经验,采用体内灌流,原位消化,体外酶解,结合密度梯度离心等多种方式,对肝脏中不同类型,直径的细胞进行差异化的分离,获得了比较好的效果。在初始解离的样本质量效果不佳时,结合一些红细胞裂解,去除细胞碎片,去除死细胞的流程,也可有效提升细胞活率。”

对于多组学技术她总结道,目前成熟商业化的单细胞技术已经覆盖了单细胞基因组、转录组、免疫组、蛋白组、表观组,并且可以做到对同一个样本进行多组学的检测,在基础功能研究、发育分化、疾病诊疗等方向均带来了科学性突破,科研和药企客户对单细胞水平多组学技术有着爆发式需求。多组学的联合分析能够获得对细胞事件的全面了解,未来多组学发展将带给我们更多更前沿的技术和展望。

问题集锦回顾

小编整理了在线观众的问题及答案,与大家共享。

问1

一个解离管中,最少和最多可以放入多少的样本?

答1

经过内部测试,目前给出的建议样本投入量是10-600mg。PythoN特别是在投入样本量比较少的情况下,细胞活性和细胞得率都表现优异,可以适用于临床穿刺样本的解离的。

问2

后续想做单细胞多组学研究,使用PythoN解离得到的单细胞悬液,可以用于后续像是原代细胞培养,流式分选,免疫磁珠分选等实验吗?

答2

目前PythoN的试剂耗材都是经过环氧乙烷无菌处理的,我们也测试了原代细胞培养和部分抗原的流式分选实验,也在客户端进行了原代细胞培养和流式分选实验,这些都是没有问题的。

问3

直播中看见可以直接选择已经设置好的程序,目前仪器可以适用于多少种样本,可以自行调整解离程序吗?
答3

目前仪器我们已经测试约40种不同样本的解离。仪器有程序录入和程序修改界面,可自行调整转速,正转时间、反转时间、循环数等参数,而且还可最多存储30种不同的程序,下次使用的时候可以直接调用。

问4

实验人员直接向解离管中加入的是解离液,这边配套是直接提供配置好的液体试剂吗?

答4

是的,目前我们是直接提供已经配置好的液体试剂,这样就不需要再配置。

问5

新格元这种细胞解离有没有在大型哺乳动物的器官上做一些测试?

答5

目前内部测试集中在小鼠和人的组织上,但是我们在邀请全国客户做PythoN组织解离仪器的Demo测试,感兴趣的老师可以申请。

 

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基因科技基因科技管理团队
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