近年来,单细胞测序作为新兴的测序技术,在单个细胞的不同组学层面分析肿瘤细胞亚群、揭示细胞异质性和研究肿瘤的发生、演变及耐药性等方面具有独特的优势,为探索恶性肿瘤的临床诊治和预后判断等提供了新方法和新思路。
2021年8月31日,序祯达生物科技发起“新格元单细胞测序创新型产品介绍”线上直播课,邀请新格元生物科技有限公司(以下简称“新格元”)的产品经理方惠敏老师担任本期序祯达直播间的主讲嘉宾,围绕单细胞测序技术在不同研究领域的应用,从样品制备,到后期数据分析和挖掘等,与大家分享科研成果和经验心得,进一步推动单细胞研究技术的应用,促进科研成果转化。
什么是单细胞测序?
基础定义:单细胞测序是将单个细胞分离,构建文库并测序,获取单个细胞水平信息的技术。
高通量单细胞测序技术:一次性检测数千甚至上万个细胞中基因信息的技术,被称为高通量单细胞测序技术。
单细胞测序流程:样本运输、组织解离、单细胞分离和核酸捕获、测序文件构建、NGS测序、数据质控分析
精准解析加速药物研发
在直播中方惠敏老师介绍道,“对于之前的单细胞转录组技术,获得的是某一时间点转录情况,但活细胞处于不断的新陈代谢中,了解细胞的转录活跃度非常重要,基于此推出的DynaSCOPE™单细胞转录动态监测试剂盒,能够准确提供转录本在单位时间上的动态变化,精准解析细胞中的哪些RNA分子是“新”生成的,哪些是“旧”的。”
▲DynaSCOPE™单细胞转录动态测序技术原理
DynaSCOPE™单细胞转录动态测序技术主要能够实现:
◆评估新生RNA水平和RNA合成率
◆监测RNA的降解速率
◆分析转录组的动态表达
◆转录调控机制预测
主要研究领域包括转录动力学研究,药物刺激后细胞转录研究,发育研究和病毒感染对宿主影响研究等。
方惠敏老师通过不同案例来具体介绍了这项技术的优势及应用场景,“新生RNA的研究对于区分不同反映情况的细胞亚型、细胞状态变化和理解基因表达调控的重要性不言而喻。DynaSCOPE™为转录组动态研究提供了更高的可能性。”
另外她补充道,“最近推出的新产品AccuraCode®高通量药物筛选RNA建库试剂盒,以微孔板作为反应载体,将逆转录(reverse transcription, RT)和PCR扩增步骤合并,在高通量PCR板中仅需一步(OneStep)即可高效获得各孔中的cDNA分子,可从多基因表达谱进行药物筛选,为先导化合物的筛选提供更多的信息。AccuraCode®试剂盒将每孔的cDNA混合纯化,构建一个含多种药物化合物处理的混合RNA-seq文库,高通量测序后,根据孔标签(Well Barcode)信息拆分出不同药物处理下细胞系的基因表达信息,使得高通量多组学联合分析应运而生,成为药物筛选研究的得力工具。”
▲AccuraCod®技术流程
此次在序祯达直播间展示的创新单细胞测序技术带来了大量前沿研究进展。据统计目前单细胞测序的全球潜在市场价值已经达到 130 亿美元,方惠敏老师也表示,单细胞测序在临床和药物开发方面的应用前景广阔,也可用于新兴的免疫治疗,细胞及基因治疗等系统性疗法的开发,未来大量的市场需求也将会推动单细胞测序行业的进一步发展。
伴随直播的圆满落幕,我们期待着凭借序祯达多组学技术的平台优势,未来联合领域内的高级领袖、行业专家、知名企业精英们,为大家提供更开阔的技术探讨交流平台,打开需求的“闸门”,畅通理论研究和加速成果转化,全面助力创新药物研发。
关于新格元
新格元生物成立于2018年,专注高通量单细胞多组学平台产品的自主开发及临床转化。公司成立后发展迅速,现已拥有国际领先的一站式高通量单细胞测序平台,提供从组织样本处理,高通量单细胞分离及测序文库构建,到数据分析和临床意义挖掘的全面解决方案。现有产品包括自主开发生产的Singleron Matrix®自动化单细胞测序文库构建仪器,PythoN™组织解离仪,GEXSCOPE®高通量单细胞转录组试剂盒、单细胞核转录组试剂盒、免疫受体试剂盒,DynaSCOPE™海量单细胞转录组动态监测试剂盒,FocuSCOPE™靶向高通量单细胞测序产品,AccuraCode®高通量药物筛选RNA建库试剂盒,CeleScope™生信分析软件,及SynEcoSys®单细胞数据库,并已服务400余家知名医院,药企,及科研院所。
关于序祯达
序祯达生物科技是中国领先的多组学研究和临床服务提供商,致力于基因组学、蛋白组学和其他相关服务。本着以研究为首任,以客户为中心的宗旨,支持药物研发企业进行药物筛选、生物标记物发现和临床试验。
序祯达生物科技提供按照CLIA/CAP标准验证的多样化基因组学和蛋白组学检测,包括基因分型和基因表达qPCR检测,NGS检测和蛋白质生物标志物检测。
其中最具特色的检测包括FoundationOne CDx、用于组织和ctDNA的Illumina TSO500、10x Genomics单细胞解决方案、Olink Target 96/48、Olink Explore 1536/384及宏基因组、mRNA、smRNA、全基因组和外显子组测序等,并可根据项目需求提供定制化检测。更多信息请访问www.sequanta.com
基因科技门户GeneTechCn.com精选文章《基于高通量单细胞测序平台革新精准医疗》文中所述为作者独立观点,不代表基因科技门户立场。如若转载请注明出处:https://www.genetechcn.com/434.html