ProMoSCOPE™高通量单细胞糖基化解决方案

PART 01 审时度势看背景

糖基化作为一种常见的蛋白翻译后修饰，在真核细胞中广泛存在，不同细胞类型的糖基化在类型和数量上也有较强的异质性。在糖基转移酶作用下将糖类转移至蛋白质，与蛋白质上特殊的氨基酸残基形成糖苷键是糖基化的基本过程。细胞膜表面的糖基化可以增加膜蛋白的稳定性，也是细胞膜表面信号的特征之一。

图自Glycosylation in cancer: mechanisms and clinical implications

在组织和细胞中，糖基化主要参与调控蛋白质的定位、功能和活性，影响细胞识别、分化、信号转导、免疫应答等多种重要的生命活动。糖基化异常可导致肿瘤、糖尿病、心血管和神经退行性疾病等多种病症。比如，与正常细胞相比，肿瘤细胞表现出广泛的糖基化改变，进而增加肿瘤异质性，还可以通过聚糖结合受体诱导免疫抑制信号。又或者，体内的葡萄糖分子或其他糖类分子错误地连接到蛋白质上，会引起蛋白质变性，这一有害反应与氧化反应类似，也是引发糖尿病并发症的重要因素。

PART 02 化繁为简识技术

近年来，糖基化的相关研究逐渐增多，呈“突飞猛进”的趋势；而单细胞水平的糖基化研究还不多。一方面单细胞糖基化技术还不成熟；另一方面，scGR-seq、SUGAR-seq等方法尚未走出实验室，目前还没有一个易用的、商业化的单细胞糖基化技术。

糖基化NCBI文章发表数量图

序祯达生物单细胞平台：ProMoSCOPE™高通量单细胞糖基化解决方案来啦！

原理

ProMoSCOPE™单细胞糖基化检测技术，是首个商业化的在单细胞分辨率下同时检测单细胞转录组和细胞表面糖基化的技术。基于酶促糖基化原理，在测序前经过糖基转移酶连接Tag，为细胞轻松带上糖基化“小标签”。

ProMoSCOPE™原理图

流程

ProMoSCOPE™具有简单的工作流程，可同时分析数千个细胞的糖基化水平，适用于疾病机制和肿瘤侵袭、肿瘤异质性研究、免疫应答研究和宿主-病原体相互作用等方向的研究。

ProMoSCOPE™流程图

ProMoSCOPE™拥有从样本制备到数据分析的完整流程：

⚪利用ProMoSCOPE™连接样本细胞，使其携带特异的Tag barcode信息，再利用GEXSCOPE®微流控芯片捕获单细胞。

⚪细胞裂解后，GEXSCOPE®分子标签磁珠通过捕获成熟mRNA末端的poly-A，使细胞内mRNA和Tag barcode被加上相同的Cell Barcode。

⚪逆转录成cDNA之后，分别进行Tag标签文库及单细胞转录组文库的构建，上机测序。

⚪得到下机数据，用开源软件CeleScope®进行分析，定量后得到样本的糖基化水平及单细胞转录组信息。

亮点

选择ProMoSCOPE™，您可以得到：

⚪组分全面：试剂盒包含转录组建库试剂组分及糖基化标记及建库组分，无需购买额外的试剂。

⚪单细胞多组学：同时获得单细胞转录组和糖组学信息。

⚪高覆盖率：定量多种糖基化信息。

PART 03 序祯达助力单细胞多组学研究

糖组学技术与基因组学和蛋白质组学数据结合时，将会成为一种有力的多组学工具。如何在单细胞水平把糖组学数据和转录组学和表现型分析的数据整合在一起，并给出生物学功能的解释是糖生物学正要回答的问题。

序祯达生物拥有多样化的单细胞多组学研究平台，可提供高通量单细胞转录组、基因组和蛋白组研究分析服务，对于各类肿瘤组织、骨髓、PBMC等临床样本，小鼠肝脏、脾脏、肿瘤等类型样本都具有丰富的项目经验，支持从样本处理，建库测序，到数据分析的全流程服务。糖组学分析产生的海量数据，可广泛应用到基础科研、药物靶点发现、新药开发、毒理学研究、疾病预防和诊断等领域。

参考文献

[1] Schjoldager KT, Narimatsu Y, Joshi HJ, Clausen H. Global view of human protein glycosylation pathways and functions. Nat Rev Mol Cell Biol. 2020 Dec;21(12):729-749. doi: 10.1038/s41580-020-00294-x. Epub 2020 Oct 21. PMID: 33087899.

[2] RodrÍguez E, Schetters STT, van Kooyk Y. The tumour glyco-code as a novel immune checkpoint for immunotherapy. Nat Rev Immunol. 2018 Mar;18(3):204-211. doi: 10.1038/nri.2018.3. Epub 2018 Feb 5. PMID: 29398707.

[3] Pinho SS, Reis CA. Glycosylation in cancer: mechanisms and clinical implications. Nat Rev Cancer. 2015 Sep;15(9):540-55. doi: 10.1038/nrc3982. Epub 2015 Aug 20. PMID: 26289314.